Dalsze badania nad bakteriami jelitowymi i zdrowiem

Nowe badanie, przeprowadzone przez połączenie danych z większości tych badań, rzuca zimną wodę na pomysł, że dodatkowe kilogramy mogą wynikać z braku równowagi bakterii w nas.

W rzeczywistości badanie opublikowane w czasopiśmie mBio stwierdza, że ​​nie ma wyraźnej wspólnej cechy populacji drobnoustrojów lub mikrobiomów w układzie pokarmowym osób otyłych, która odróżniałaby je od mikrobiomów osób o prawidłowej wadze.

Ten brak wyraźnego „podpisu” u ponad 1,000 ochotników w 10 największych badaniach przeprowadzonych do tej pory może nie podobać się osobom z nadwagą. Może również rozczarować firmy, które sprzedają im produkty mające na celu zmianę mikroskopijnej populacji jelit poprzez błonnik, składniki odżywcze i „dobre” bakterie.

Jednak według naukowców z University of Michigan Medical School to odkrycie jest naprawdę ekscytujące. Oznacza to, że istnieje znacznie większa złożoność – a zatem znacznie więcej do nauczenia się – jeśli chodzi o związek między naszym mikrobiomem a naszym zdrowiem.

Naukowcy stworzyli otwartą witrynę internetową, na której inni badacze mogą zobaczyć, jak zrobili to, co zrobili, i dodać więcej danych z badań mikrobiomu jelitowego u osób otyłych i nieotyłych, aby kontynuować wyszukiwanie wszelkich linków.


wewnętrzna grafika subskrypcji


W miarę dodawania kolejnych danych wiarygodność wyników będzie tylko rosła. I być może w przyszłości zostaną znalezione konkretne powiązania i podpisy.

Marc Sze, pracownik naukowy z tytułem doktora, który opublikował analizę z profesorem mikrobiologii Patrickiem Schlossem, mówi, że skala problemu otyłości oznacza, że ​​o wiele ważniejsza jest pewność co do nauki.

„Otyłość stanowi obecnie zagrożenie dla zdrowia o rozmiarach epidemii, a wielu sugeruje, że mikrobiom bakteryjny nie tylko różni się między osobami otyłymi i nieotyłymi, ale także może przewidywać otyłość” – mówi Sze. „Chcieliśmy sprawdzić, czy tak właśnie sugerowała istniejąca literatura, ponieważ te twierdzenia mogą mieć duży pozytywny wpływ na zarządzanie tą epidemią, jeśli są prawdziwe”.

Schloss dodaje: „Ostatecznie stwierdziliśmy, że nie ma wyraźnych sygnatur ani predyktorów otyłości w dotychczas zgłoszonych danych dotyczących mikrobiomu, a jeśli w ogóle istnieje sygnatura związana z różnorodnością drobnoustrojów, nie jest biologicznie przydatna. To przestroga, która wskazuje na potrzebę wykonania większej ilości pracy w celu wyjaśnienia tego, co wiemy, a czego nie”.

Narzędzia open source

Pomysł, że otyłość i brak równowagi mikrobiomów są powiązane, zaczął się od badań na zwierzętach i obserwacji, że otyłe zwierzęta mają tendencję do posiadania pewnego stosunku dwóch grup gatunków bakterii. Doprowadziło to do badań na ludziach – niektóre z nich z zaledwie kilkudziesięcioma uczestnikami – które trafiły na nagłówki gazet w ostatnich latach.

Ale ludzie i gryzonie hodowane do użytku laboratoryjnego są bardzo różne i potrzebne są duże próbki ludzi, aby powiedzieć coś ostatecznego na temat zdrowia ludzkiego i jego związku z mikrobiomem.

Do przeprowadzenia analizy Sze i Schloss wykorzystali narzędzia komputerowe do uczenia maszynowego opracowane w laboratorium Schloss w ostatnich latach. Obejmowało to program o nazwie mothur, który daje badaczom mikrobiomu bezpłatne narzędzie typu open source do badania ogromnej ilości danych, które mogą wyłonić się z badań mikrobiomu.

Stworzyli model klasyfikacji, który uwzględnia wszystkie dane o różnych gatunkach drobnoustrojów obecnych w mikrobiomie danej osoby oraz inne informacje. Następnie próbowali użyć go do przewidzenia, czy dana osoba jest otyła, czy nie.

Chociaż narzędzie działało nieco, gdy używali go na danych z jednego z 10 badań przeprowadzonych przez innych, nie przewidywało już dobrze otyłości, gdy używali go na danych z innych badań.

„Tak naprawdę nie ma jednego „zdrowego” mikrobiomu” – mówi Schloss. „Można spojrzeć na setki ludzi i wszyscy mogą mieć bardzo różne populacje drobnoustrojów w swoich jelitach. Tak więc pomysł, że możemy poprawić twój mikrobiom, wykonując jedną prostą rzecz, również nie sprawdza się.”

To powiedziawszy, ogólnie przyjęte zdrowe nawyki żywieniowe, które dostarczają drobnoustrojom jelitowym dużo błonnika i składników odżywczych do żucia, nie mogą zaszkodzić, dodaje.

Rak jelita grubego

Zespół opracowuje podobne narzędzie do wykorzystania w ocenie możliwych powiązań mikrobiomu jelitowego z rakiem okrężnicy. Na początku tego roku opublikowali wyniki analizy kilkuset osób i wykazali, że ich narzędzie ma rozsądną dokładność w wykrywaniu sygnatur mikrobiomu, które są częstsze u osób z rakiem okrężnicy niż u osób bez raka.

„Będziemy nadal stosować te podejścia, aby przyjrzeć się mikrobiomowi i rakowi jelita grubego” – mówi Sze. „Chcemy również wyciągnąć wnioski, które wynieśliśmy z pracy z dużymi zestawami danych i zastosować je w naszych badaniach nad wpływem mikrobiomu bakteryjnego w rodzinach na dziedziczne nowotwory jelita grubego”.

Ostatecznie celem tej pracy może być nowe narzędzie diagnostyczne do wykrywania raka okrężnicy lub ryzyka raka na podstawie próbki kału.

Innym potencjalnym obszarem badań nie jest różnorodność drobnoustrojów obecnych w jelitach, ale raczej stopień, w jakim wytwarzają one produkty rozkładu związane z ich rolą w procesie trawienia. Te cząsteczki, zwane metabolitami, mogą tworzyć bardziej znaczącą sygnaturę aktywności drobnoustrojów.

Bez względu na wszystko, mówi Schloss, ważną rzeczą we wszystkich pracach nad mikrobiomem jest nie branie ekscytujących początkowych wyników jako ostatniego słowa.

„Musimy posunąć do przodu naukę i bardziej krytycznie myśleć o uzyskiwanych wynikach” – mówi o wszystkich mikrobiomach. „Istnieje potrzeba weryfikacji krzyżowej i zrozumienia, że ​​możemy uzyskać różne wyniki w różnych populacjach”.

National Institutes of Health sfinansował badania.

Źródło: University of Michigan

Powiązane książki

at

złamać

Dzięki za odwiedziny InnerSelf.com, gdzie są 20,000 + zmieniające życie artykuły promujące „Nowe postawy i nowe możliwości”. Wszystkie artykuły są tłumaczone na 30+ języków. Zapisz się! do wydawanego co tydzień magazynu InnerSelf i Daily Inspiration Marie T Russell. Magazyn InnerSelf ukazuje się od 1985 r.