Pracownik służby zdrowia wykonuje u pacjenta wymaz na COVID. Istnieje kilka powodów, dla których test RT-PCR może dawać fałszywie dodatni wynik. Shutterstock

Dwa przypadki COVID-19 wcześniej powiązane z obecną epidemią w Melbourne zostały teraz przeklasyfikowany jako fałszywe alarmy.

Nie są one już uwzględniane w oficjalnych liczbach spraw Wiktorii, a wiele stron z informacjami, które prowadzą do tych spraw, zostało usuniętych.

Głównym i „złotym standardem” testem do wykrywania SARS-CoV-2, wirusa wywołującego COVID-19, jest test łańcuchowej reakcji polimerazy z odwrotną transkryptazą (RT-PCR).

Test RT-PCR jest bardzo specyficzny. Oznacza to, że jeśli ktoś naprawdę nie ma infekcji, istnieje duże prawdopodobieństwo, że wynik testu będzie negatywny. Test jest również bardzo czuły. Tak więc, jeśli ktoś naprawdę jest zarażony wirusem, istnieje duże prawdopodobieństwo, że wynik testu będzie pozytywny.


wewnętrzna grafika subskrypcji


Ale nawet jeśli test jest wysoce specyficzny, to nadal pozostawia niewielką szansę, że ktoś, kto nie ma infekcji, zwróci pozytywny wynik testu. To właśnie oznacza „fałszywy pozytyw”.

Po pierwsze, jak działa test RT-PCR?

Chociaż w wieku COVID większość ludzi słyszała o teście PCR, jak to działa jest, co zrozumiałe, trochę tajemnicą.

Krótko mówiąc, po pobraniu wymazu z nosa i gardła do ekstrakcji RNA (kwasu rybunokleinowego, rodzaj materiału genetycznego) z próbki stosuje się chemikalia. Obejmuje to zwykłe RNA i RNA danej osoby z wirusa SARS-CoV-2, jeśli jest obecny.

Ten RNA jest następnie przekształcany w kwas dezoksyrybonukleinowy (DNA) — to właśnie oznacza bit „odwrotnej transkryptazy”. Aby wykryć wirusa, amplifikuje się maleńkie segmenty DNA. Za pomocą specjalnego barwnika fluorescencyjnego próbka jest identyfikowana jako dodatnia lub ujemna na podstawie jasności fluorescencji po 35 lub więcej cyklach amplifikacji.

Co powoduje fałszywie pozytywne wyniki?

Połączenia główne powody dla wyników fałszywie dodatnich są błędy laboratoryjne i reakcja niecelowa (czyli test reagujący krzyżowo z czymś, co nie jest SARS-CoV-2).

Błędy laboratoryjne obejmują błędy pisarskie, testowanie niewłaściwej próbki, zanieczyszczenie krzyżowe z cudzej próbki pozytywnej lub problemy z używanymi odczynnikami (takimi jak chemikalia, enzymy i barwniki). Ktoś, kto miał COVID-19 i wyzdrowiał, może również wykazać fałszywie dodatni wynik.

Jak często występują wyniki fałszywie dodatnie?

Aby zrozumieć, jak często pojawiają się wyniki fałszywie dodatnie, przyjrzymy się wskaźnikowi wyników fałszywie dodatnich: odsetkowi osób przebadanych, które nie mają infekcji, ale zwracają wynik dodatni.

Autorzy najnowszego przedruk (artykuł, który nie został jeszcze zrecenzowany lub niezależnie zweryfikowany przez innych badaczy) podjął się przeglądu dowodów na odsetek wyników fałszywie dodatnich dla testu RT-PCR stosowanego do wykrywania SARS-CoV-2.

Połączyli wyniki wielu badań (niektórzy przyglądali się testom PCR dla SARS-CoV-2, a niektórzy przyglądali się testom PCR dla innych wirusów RNA). Stwierdzili, że odsetek wyników fałszywie dodatnich wynosi 0-16.7%, a 50% badań wynosi 0.8-4.0%.

Odsetki wyników fałszywie pozytywnych w przeglądzie systematycznym opierały się głównie na testach zapewnienia jakości w laboratoriach. Jest prawdopodobne, że w rzeczywistych sytuacjach dokładność jest słabsza niż w badaniach laboratoryjnych.

A przegląd systematyczny patrząc na odsetek wyników fałszywie ujemnych w testach RT-PCR na SARS-CoV-2, odsetek wyników fałszywie ujemnych wynosił 1.8-58%. Zwracają jednak uwagę, że wiele badań było niskiej jakości, a wyniki te są oparte na dowodach niskiej jakości.

Żaden test nie jest doskonały

Załóżmy na przykład, że w przypadku testów SARS-CoV-4 RT-PCR odsetek wyników fałszywie pozytywnych w świecie rzeczywistym wynosi 2%.

Na każde 100,000 4,000 osób, które mają wynik negatywny i naprawdę nie mają infekcji, spodziewamy się XNUMX fałszywie pozytywnych wyników. Problem w tym, że w przypadku większości z nich nigdy o nich nie wiemy. Osoba, która uzyskała wynik pozytywny, zostaje poproszona o poddanie się kwarantannie i wszyscy zakładają, że choroba przebiegała bezobjawowo.

Jest to również zdezorientowane faktem, że odsetek wyników fałszywie dodatnich zależy od podstawowej częstości występowania choroby. Przy bardzo niskiej częstości występowania, jak widzimy w Australii, liczba fałszywych trafień może być znacznie wyższa niż rzeczywista prawdziwa liczba trafień, coś znanego jako fałszywie pozytywny paradoks.

Ze względu na charakter obecnej epidemii Wiktorii, władze prawdopodobnie zachowują szczególną czujność przy wynikach testów, co potencjalnie zwiększa prawdopodobieństwo wykrycia fałszywych alarmów. Rząd wiktoriański powiedział::

Po analizie przeprowadzonej przez panel ekspertów i ponownym przeprowadzeniu testów przez Victorian Infectious Diseases Reference Laboratory, dwa przypadki związane z tą epidemią zostały uznane za fałszywie dodatnie.

To nie wyjaśnia, czy dwie osoby zostały ponownie przetestowane, czy tylko próbki zostały ponownie przetestowane.

Tak czy inaczej, niefortunne jest posiadanie dwóch fałszywych alarmów. Ale biorąc pod uwagę dużą liczbę osób poddawanych obecnie codziennym testom w Wiktorii oraz fakt, że wiemy, że pojawią się fałszywe alarmy, nie jest to nieoczekiwane.

Szersze implikacje

W przypadku osoby, która otrzymała fałszywie dodatni wynik testu, byłaby zmuszona przejść do kwarantanny, gdy nie było takiej potrzeby. Powiedzenie, że masz potencjalnie śmiertelną chorobę, jest bardzo stresujące, szczególnie dla osób starszych lub zagrożonych z powodu innych schorzeń. Prawdopodobnie obawialiby się również zarażenia innych członków swojej rodziny i mogliby stracić pracę podczas kwarantanny.

Zwłaszcza podane organy początkowo wskazały na te dwie sprawy . jako przykłady transmisji wirusa poprzez „ulotny” kontakt, bez wątpienia wiele osób zastanawiało się, czy bez tych przypadków Victoria nie byłaby w zamknięciu. To tylko przypuszczenie i tak naprawdę nie możemy wiedzieć, czy to możliwe.

Fałszywe negatywne wyniki są wyraźnie bardzo niepokojące, ponieważ nie chcemy, aby zakaźne osoby wędrowały po społeczności. Ale fałszywe alarmy również mogą być problematyczne.

O autorze

Adrian Esterman, profesor biostatystyki i epidemiologii, University of South Australia

książki_choroba

Artykuł pierwotnie pojawił się na Konwersacje